Windows 11でフォルダーの移動やコピーをした際、同名のフォルダーがあっても中身が異なっていれば上書き（結合）されますが、【フォルダーの上書きの確認】のダイアログを表示して結合するか選択するようにできます。
エクスプローラーでフォルダーの結合の競合が非表示
デフォルトでは移動／コピー先に同名フォルダーがあるとき、フォルダー内にファイル名が同じファイルがある場合にのみファイルの置換またはスキップダイアログが表示されます。
逆に、すべてのファイル名が異なる場合はダイアログが表示されることなく上書き（結合）されますが、これはエクスプローラーのフォルダーオプションによってフォルダーの結合の競合を非表示にするがオンであることが理由です。
そのため、これをオフにすればフォルダーの上書きの確認ダイアログを表示できます。
“フォルダーの上書きの確認”ダイアログを表示する手順
エクスプローラーの…よりオプションをクリックします。
フォルダーオプションの表示よりフォルダーの結合の競合を非表示にするのチェックを外します。
“フォルダーの上書きの確認”ダイアログを表示するやり方は以上です。